Mapeamento da fauna bacteriana em tecido muscular de tambaqui (Colossoma macropomum) por metabarcoding 16S rRNA

Descrição

O tambaqui (Colossoma macropomum) representa uma das principais espécies consumidas na Amazônia, também com grande relevância econômica, social e alimentar para a região. No entanto, eventos recentes associados à ocorrência da doença de Haff no estado do Amazonas têm despertado preocupação quanto à segurança do consumo de pescado e aos possíveis agentes etiológicos envolvidos. Apesar dos avanços nas investigações, a origem dessa síndrome ainda permanece incerta, sendo levantada a hipótese da participação de microrganismos e/ou toxinas associadas ao ambiente aquático e ao pescado. Nesse contexto, a presente pesquisa propõe a análise da comunidade bacteriana presente em tecido muscular de tambaqui por meio de metabarcoding do gene 16S rRNA, utilizando dados previamente obtidos por sequenciamento de nova geração (NGS). As coletas foram em áreas com registros da doença, no município de Itacoatiara-AM, e em área controle, no município de Iranduba-AM, permitindo uma abordagem comparativa entre diferentes cenários epidemiológicos. As amostras já foram processadas em laboratório para sequenciamento do DNA. Os dados de sequenciamento, disponibilizados em arquivos FASTQ, serão processados e analisados na plataforma BaseSpace, utilizando pipelines de análise secundária baseados no algoritmo DRAGEN e 16S Metabarcoding. Inicialmente, será realizado o controle de qualidade das leituras, seguido da classificação taxonômica das sequências bacterianas com base em bancos de dados genéticos de referência. A partir desses resultados, será conduzido um screening da diversidade microbiana, com geração de perfis taxonômicos e análise de abundância relativa. Posteriormente, será realizada a filtragem de potenciais patógenos de interesse, com base em literatura especializada e registros de bactérias associadas a peixes e doenças de origem alimentar, permitindo a identificação de microrganismos com possível relevância sanitária e epidemiológica. Esta pesquisa integra e dá suporte às investigações desenvolvidas nos projetos “Rastreamento molecular em DNA ambiental de possíveis patógenos associados à doença de Haff no Estado do Amazonas”, financiado pela FAPEAM (Edital n. 008/2022 – KUNHÃ), e “Explorando os mistérios da doença de Haff: uma investigação molecular e química aplicada ao rastreio de possíveis patógenos”, financiado pela FAPEAM (EDITAL N. 006/2024 - MULHER FAZ CIÊNCIA), ampliando o entendimento sobre a diversidade microbiana associada ao pescado e seu potencial papel na ocorrência da doença. Espera-se que os resultados obtidos contribuam para o avanço do conhecimento sobre a microbiota associada ao tambaqui, auxiliem na identificação de possíveis agentes envolvidos na doença de Haff e fortaleçam estratégias de monitoramento sanitário, segurança alimentar e saúde pública na região amazônica.