Ferramentas citogenéticas e genômicas aplicadas ao estudo da biodiversidade de Leguminosae Juss. (Fabaceae Lindl.)

Descrição

Os avanços nas estratégias de sequenciamento de nova geração (NGS, do inglês Next Generation Sequencing) têm permitido a análise de quantidades massivas de sequências de DNA e revolucionado a compreensão da biodiversidade. Dada a megadiversidade vegetal do Brasil, a família Leguminosae (Fabaceae) se destaca como a terceira maior família de Angiospermas, citada como uma das mais ricas nas diferentes fitofisionomias do nosso país. Nesse sentido, a sistemática molecular dos legumes avançou muito nos últimos anos no que diz respeito ao entendimento das suas relações evolutivas, principalmente com o advento de ferramentas filogenômicas, citomoleculares e genômicas. Assim, é possível testar as novas propostas filogenéticas/taxonômicas à luz da análise das frações repetitivas dos genomas, por exemplo caracterizando elementos repetitivos para hibridização in situ fluorescente (FISH) e/ou identificando sinapomorfias genômicas de clados com posicionamento controverso. Neste sentido, o presente projeto tem como objetivo utilizar ferramentas citogenéticas e genômicas para entender a biodiversidade de grupos complexos da família Leguminosae (Fabaceae), tendo como objetivos específicos: i) Investigar as relações filogenômicas de populações naturais remanescentes de Pau-brasil (Paubrasilia echinata, Caesalpinioideae), baseado na análise comparativa dos seus repeatomas; ii) Conduzir uma analisar genômica comparativa de representantes do populações naturais de Pau-ferro (Libidibia ferrea, Caesalpinioideae) com foco em discutir o status taxonômico de citótipos diploides e poliploides distribuídos ao longo da Caatinga e Mata Atlântica e iii) Investigar a diversificação cromossômica e genômica de representantes do clado ADA (Papilionoideae), contribuindo para o entendimento da sua sistemática e evolução. Para isso, integraremos sequenciamentos NGS (Illumina e PacBio) para a montagem de genomas nucleares e plastidiais, caracterização de repeats, análises filogenômicas e correlação com variáveis ambienatais, citometria de fluxo, contagens cromossômicas e FISH para a localização cromossômica dos DNAs repetitivos.