Prospecção de compostos naturais bioativos por meio de estratégias integradas de bioinformática para identificação de alvos moleculares e priorização de candidatos a fármacos

Descrição

Os produtos naturais constituem importante fonte de diversidade química e de moléculas com potencial bioativo. Entretanto, muitos compostos naturais permanecem pouco caracterizados quanto às propriedades moleculares e aos potenciais alvos associados às suas estruturas. Nesse contexto, estratégias computacionais de target fishing permitem investigar possíveis alvos biológicos partindo da estrutura química do composto, sem a necessidade de definir previamente uma doença ou proteína. Este projeto propõe uma investigação integralmente in silico de compostos naturais por meio de um pipeline baseado exclusivamente na plataforma SwissDrugDesign. Os compostos serão selecionados a partir de informações disponíveis na literatura e em bases de dados, submetidos à curadoria estrutural e posteriormente analisados quanto à similaridade molecular, potenciais alvos, propriedades físico-químicas e farmacocinéticas. O SwissSimilarity será empregado na identificação de moléculas estruturalmente relacionadas; o SwissTargetPrediction será utilizado para a prospecção de potenciais alvos moleculares; o SwissADME será empregado na caracterização das propriedades dos compostos; e o SwissDock será utilizado para investigar, por docking molecular, as interações entre compostos prioritários e seus potenciais alvos. Quando pertinente, o SwissBioisostere será empregado para explorar possibilidades de otimização estrutural. Os resultados serão integrados para estabelecer perfis moleculares e priorizar compostos e relações composto–alvo com maior convergência entre as análises. Espera-se produzir um panorama computacional dos potenciais alvos e propriedades dos compostos investigados, estabelecendo uma estratégia reprodutível de prospecção molecular de produtos naturais.